这两者间有本质的差别，这些差别包括但不限于：
(1)组织形式不同。债券基金是由基金管理公司和托管人负责募集的用于投资一揽子债券的集合理财产品;具体债券则只是由某个发行人承诺按某一期限安排支付利息和本金的合约。
(2)交易对象不同。债券基金投资者可以通过银行、证券商或者直接向基金管理人申购和赎回份额;债券投资者必须通过证券商或者银行来购买具体债券。而且，中国许多的债券仅限于在银行间债券市场流通，意味着即使有足够的购买意愿和承担能力，投资者也并不一定可以买到自己想持有的债券来投资。
(3)多样化程度不一样。债券基金的投资组合多样化程度远比一两只债券要强得多。
(4)期限不同。债券基金存续期不固定;债券有明确具体的到期日。
(5)现金流收入的规模和时间安排不同。债券基金合同既可以约定到点分红，又可以约定为视收益状况分红，其现金流规模不确定;债券的还本付息的具体数目和日期都是既定的。
(6)流动性不同。债券基金的投资者可以在任意开放日按照净值减去适用费用的价格赎回基金份额;债券投资者需要通过二级市场交易才能卖出债券。
(7)再投资难易程度不同。债券基金的投资者可以轻松安排收入或者本金的再投资;债券投资者如想再投资，既需满足市场的最低资金要求，又需要找到市场的有效供给。
(8)持有期成本不同。债券基金投资者需要付出昂贵的管理费、托管费、交易手续费等投资成本;债券投资者则可能仅需要支付一次交易手续费。
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