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呼吸道按解剖结构分为上呼吸道和下呼吸道。
◆上呼吸道感染主要指喉及喉以上的呼吸道感染。
◆下呼吸道感染主要指气管、支气管和肺的感染。
（一）上呼吸道的正常菌群
1.球菌 凝固酶阴性葡萄球菌，链球菌，微球菌，奈瑟菌，厌氧球菌。
2.杆菌 棒状杆菌，嗜血杆菌，类杆菌，梭杆菌。
（二）常见病原微生物
（三）标本采集
1.采集方法
（1）上呼吸道：常采用鼻咽拭子；在扁桃体部位、咽后壁及口腔内炎症、溃疡或渗出部位采样时，应先用清水漱口，再采集标本。
（2）下呼吸道：常采用自然咳痰法、支气管镜采集、胃内采集、咽拭子。清晨第一口痰为宜，最好在用抗菌药物前采集，必须先用清水漱口，避免唾液混入。
2.立即送检。
（四）检验方法
1.涂片：
◆检查细菌常用革兰染色、抗酸染色；
◆检查隐球菌采用墨汁染色；
◆军团菌、支原体、病毒等可用免疫荧光抗体染色。
◆合格的痰标本：
白细胞＞25个/低倍视野，鳞状上皮细胞＜10个/低倍视野。
2.分离培养
（1）痰标本的前处理一般是用无菌生理盐水将痰洗净，再加入胰酶溶液使痰均质化。
（2）普通细菌培养采用血平板、中国蓝琼脂平板或麦康凯琼脂平板、巧克力平板。
（五）临床意义
◆注意采集合格的下呼吸道标本，以提高检出率和阳性的正确率。
◆一些条件致病菌和耐药菌成为医院内肺炎的主要致病菌。
◆真菌性肺炎多为条件致病性真菌感染，常见的以白假丝酵母菌为主。
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